Wenn der Inlandsflug von BKK nach CNX separat gebucht wurde und nicht auf dem Travel Itinerary von Qatar auftaucht, dann wäre dieser Flug im Falle einer Verspätung weg und würde nicht erstattet werden. Mir ist nicht bekannt, ob QR Codeshare-Vereinbarungen mit Thai-Fluggesellschaften hat, sprich ob das Szenario, alles auf einem Ticket zu haben überhaupt möglich ist (bei Etihad gibt es beispielsweise eine Kooperation mit BangkokAir, da würde das dann sogar klappen).
Wenn ich selber das Risiko trage, den Anschluss zu verpassen, würde ich die genannte Verbindung nicht buchen. Entweder würde ich den Anschluss nach CNX deutlich später nehmen, ggf. noch ne Nacht in BKK einplanen oder eine andere Verbindung mit QR wählen, so dass ich in DOH mehr Aufenthalt hätte.