Einen Rufnummernwechsel muss man eigentlich aktiv anstoßen. Außer bei der Registrierung schert es WhatsApp und Co nicht welche Sim Karte im Handy ist oder welche bei Dual Sim aktiv ist.
Zur Ausgangsfrage. Wenn man sein WhatsApp sauber halten möchte, dann kann man parallel noch WhatsApp Business als Nutten WhatsApp betreiben. Das hilft mir in WA Ländern wie Ghana, Kolumbien, Brasilien, Indonesien....
Bei aktuellen Android Versionen kann man auch die gleiche App zweimal geschützt voneinander betreiben. Letzteres hab ich aber noch nicht ausprobiert.